Représentation des données
 
Généralement on distingue deux problématiques dans l'analyse du transcriptome: la recherche de gènes différentiellement exprimés entre deux conditions expérimentales et l'étude de profils d'expression. Pour cela, les représentations graphiques appropriées son nécessaires pour faciliter l'interprétation des résultats.
Les représentations des ratios ou log2 de ratios d'expression sous forme d'analyse en composantes principales (ACP), nuées dynamiques (k-means) et regroupements hiérarchiques sont réalisées avec des logiciels d'accès libre:
J-Express
TIGR Multiexperiment viewer (MeV)
Tree view
Représentation sous forme d'analyse en composantes principales
 
Représentation sous forme de k-means
Représentation des valeurs de log2 de ratios d'expression sous forme de cluster
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